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新冠變異毒株使得少部分檢測試劑失效,生產企業正改善這一問題

科學 界面新聞

記者 | 金淼

編輯 | 許悅

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更具傳播能力的冠狀病毒變異毒株正在席捲全球,科學家們正爭分奪秒的瞭解為什麼這些變異毒株傳播更快,以及對於疫苗和檢測試劑來講,這些變異會造成哪些影響。

目前來看,英國和南非發現的新型冠狀病毒變異毒株似乎更易傳播,而疫苗和治療手段對於南非變異毒株可能不太有效。

除了使現有的疫苗和治療手段都面臨有效性的考驗外,新冠變異毒株也可能降低新冠檢測試劑的有效性。

此前世界衛生組織對於變異新冠病毒可能使得新冠檢測試劑失效問題表示,變異病毒中出現的69-70del缺失,可能會讓部分使用S基因靶標的檢測試劑受到影響。

刺突狀的S蛋白是新冠病毒最重要的表面膜蛋白,決定新冠病毒的宿主範圍和特異性。

絕大多數的診斷試劑還未受到影響,在246個FDA授權的檢測中,有85%的檢測試劑不依賴S基因,而是通過尋找N基因。約翰斯霍普金斯健康安全中心的免疫學家Gigi Kwik Gronvall在接受華爾街日報採訪時表示,大多數檢測試劑仍然沒有問題,因為這些檢測試劑的靶標並非S基因。

但包括賽默飛世爾生產的少部分試劑產品受到影響。

賽默飛世爾表示,其一款產品在去年9月和10月間收到了來自英國的報告,表明無法找到英國變異毒株。去年12月,該公司又收到來自美國的相同報告。據此,賽默飛已經開發了更新軟件,幫助實驗室去標記這部分,並且開發了新的測試產品,能夠識別與關鍵變異相關的病毒突變。

世界衛生組織曾建議使用針對S基因檢測產品,可同時平行使用針對不同病毒基因的多靶標檢測,以減少對檢測準確性的影響。

許多試劑製造企業也在通過增加靶標,以使得檢測更加有效,比如賽默飛世爾的TaqPath組合試劑盒則通過搜尋S基因在內的三個靶標來實現檢測,而即使其中S靶標因英國變種導致缺失,其他兩個靶標也能夠幫助檢測完成檢測。

鹽湖城奧雅納實驗室臨床微生物學主任 Kimberly Hanson在此前一次媒體溝通中表示,在檢測時,三個靶標中的兩個出結果,就可以稱之為陽性檢測了。

2月8日,猶他州的ARUP實驗室通過篩選7.7萬份賽默飛世爾的檢測結果發現大約有400例檢測中S蛋白項缺失,賽默飛對其中150個樣本進行了全基因組測序,發現了其中4例系出現了英國新冠變異毒株。

雖然S基因的失效,但是其對於病毒的區分也有重要意義。

而一旦出現S基因缺失的情況則也會反映病毒的變異及傳播速度,目前基因測序公司Helix正在對加州和佛羅裡達州的檢測結果進行跟蹤,以發現變異情況。

拜登政府也於本週內表示,疾控中心將投資約2億元,擴大病毒基因測序規模,以追蹤新出現的變異。

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